В настоящее время НТЦ микроэлектроники РАН ведет исследования по следующим направлениям:
(утверждены постановлением Президиума РАН № 154 от 09.06. 2009 г.)
Деятельность НТЦ микроэлектроники РАН направлена на выполнение фундаментальных научных исследований и прикладных разработок в области «Индустрия наносистем и материалов», входящей в «Перечень приоритетных направлений развития науки, технологий и техники в Российской Федерации». Направления работ НТЦ микроэлектроники РАН соответствуют разделам 7, 10 Основных научных направлений Отделения нанотехнологий и информационных технологий РАН:
7 - элементная база микроэлектроники, наноэлектроники и квантовых компьютеров. Материалы для микро- и наноэлектроники. Нано- и микро-системная техника. Твердотельная электроника;10 - нанотехнологии, нанобиотехнологии, наносистемы, наноматериалы, нанодиагностика, наноэлектроника и нанофотоника.