Согласно Уставу НТЦ микроэлектроники РАН «руководство деятельностью Центра осуществляется директором Центра и Ученым советом Центра в соответствии с их полномочиями».
Процедура формирования руководства и компетенция совета регламентируются пп. 5.1 -5.14 Устава.
Директор
Устинов Виктор Михайлович
Член-корреспондент РАН. 
Доктор физико-математических наук.
Секретарь
Комарова Наталия Олеговна
тел.: +7(812) 297-4059
e-mail: info@ntcm-ras.ru
Заместителя директора по научной работе
  
Цацульников Андрей Федорович
Кандидат физико-математических наук
тел.: +7 (812) 297-3182  
  
e-mail: info@ntcm-ras.ru
Председатель - Устинов Виктор Михайлович, член-корреспондент РАН, доктор физико-математических наук.
 
Ученый секретарь - Закгейм Александр Львович, кандидат технических наук.
  
Члены совета:
 
1. Ж. И. Алферов,	академик, д. ф.-м. н.
  
2. Д. А. Бауман,	к. ф.-м. н.
3. А. Ю. Егоров,	член-корреспондент РАН, д. ф.-м. н.
4. П. С. Копьев,	член-корреспондент РАН, д. ф.-м. н.
5. В. В. Лундин,	к. ф.-м. н.
6. Н. А. Малеев,	к. ф.-м. н.
7. М. Н. Мизеров,	к. ф.-м. н.
8. А. Ф. Цацульников,	к. ф.-м. н.
9. А. Е. Черняков,	к. ф.-м. н.